Madrasah Tsanawiyah Negeri 6 Ngawi adalah sebuah lembaga Pendidikan yang terletak di sebuah desa tidak jauh dari Kota Ngawi bahkan berdekatan dengan KUA Kecamatan Kedungalar, MI Darussalam, TK Darussalam Kedunggalar, Madrasah tepatnya berada di Desa Kdunggalar Kecamatan Kedunggalar Kabupaten Ngawi.

Madarasah Tsanawiyah Negeri 6 Ngawi berdiri pada tahun 1971 Madrasah semula bernama   Madrasah Tsanawiyah Kedunggalar Nama itu sampai tahun 1971.

Para tokoh pendiri Madrasah Tsanawiyah 6 Ngawi adalah : Bapak Ngaliman, Bapak Bapak Wahab, Bapak Maksum, Bapak Sobirin,  Bapak Samirin, Bapak Minhat salah satu sebagai Pegawai TU bersama- sama dukungan masyarakat sekitar Kedunggalar. Semuanya adalah warga Begal Kecamatan Kedunggalar yang tempat tinggalnya tidak jauh kurang lebih 5 Km dari Madrasah.

Seiring dengan perkembangan pendidikan, pada tahun 1982  Madrasah Tsanawiyah Negeri Kedunggalar.  Penggabungan itu didasarkan atas persetujuan para pendiri dan dewan guru yang ada. Perjalanan menjadi Madrasah Negeri tidak berhenti begitu saja, namun dewan guru dan seluruh komponen, Madrasah Tsanawiyah  menjadi Madrasah Tsanawiyah Negeri Kedunggalar kapasitas kelas berparalel  3. Kemudian dengan terbitnya SK menteri Agama tersebut MTs Negeri  bertambah  subur dan berkembang pesat dengan animo masyarakat yang masih kental dengan kehidupan yang agamis. Sampai sekarang Madrasah Tsanawiyah Negeri Kedunggalar Masih eksis di masyarakat  dan semakin di akui keberadaannya dalam persaingan dalam dunia pendidikan. Kini Madrasah Tsanawiyah Negeri Kedunggalar bukan lagi Madrsah yang kecil, namun Madrasah Tsanawiyah Negeri 6 Ngawi adalah Madrasah yang kompatibel dengan fasilitas lengkap yang dapat menunjang proses pendidikan dan pembelajaran anak didik .

Pada tahun ajaran 2017-2018 Madrasah Tanawiyah Negeri 6 Ngawi telah berkembang menjadi 27 kelas paralel, yaitu kelas VII berjumlah 9 kelas dengan kapasitas setiap ruang sekitar 36 siswa. Kelas VIII  8 kelas paralel dengan kapasitas setiap kelasnya sebanyak 36 anak dan kelas IX  8 kelas paralel dengan kapasitas setiap ruangnya berjumlah  38 anak.

Perjalanan selama kurang lebih 43 tahun  mulai tahun 1967 sampai  tahun 2022 Madrasah ini telah berganti  kepala Madrasah sebanyak 13 (Tiga Belas)  kali yaitu  :

1.   MOH. ALIMAN : Tahun 1969 - 1978

2.   Drs. ICHWAN : Tahun 1978 - 1990

3.   Drs. SJUHUD : Tahun 1990 - 1995

4.   Drs. DARUS : Tahun 1995 - 2000

5.   Drs. MULYONO : Tahun 2000 - 2001

6.   JUNANI, S.Ag : Tahun 2001 - 2002

7.   Drs. H. MOH SJATO : Tahun 2003 - 2006

8.   Drs. MOH. WAHIB : Tahun 2006 - 2008

9.   Drs. H. SUHUDI, M.Pd.I : Tahun 2008 - 2011

10.    Dra. ENDANG PURWANI, M.Pd.I : Tahun 2011 - 2012

11.    MUH. SUNADI, S.Ag, M.Pd.I : Tahun 2012  s/d  2016

12.    Drs. MOCH. MUQOROBIN, M.Pd.I : Tahun 2016 s/d 2021

13.    Drs. SUNARTO,M.Pd. : Tahun 2021 s/d 2013

14.    Drs. M. BISRI MUSTHOFA,M.Pd. 2023 s.d. SEKARANG